Krzysztof Cpałka był promotorem w następujących przewodach doktorskich:

• Przewodzie doktorskim mgra inż. Krystiana Łapy, który realizował pracę doktorską pt. „Algorytmy wydobywania interpretowalnej wiedzy eksperckiej w zagadnieniach modelowania nieliniowego”. Postępowanie zostało przeprowadzone na Wydziale Inżynierii Mechanicznej i Informatyki Politechniki Częstochowskiej w dziedzinie nauk technicznych w dyscyplinie informatyka i zostało ono zakończone publiczną obroną rozprawy doktorskiej w roku 2015. Praca ta została obroniona z wyróżnieniem.
  
  
• Przewodzie doktorskim mgra inż. Marcina Zalasińskiego, który realizował pracę doktorską pt. „Algorytmy weryfikacji tożsamości na podstawie dynamicznych cech podpisu odręcznego z wykorzystaniem wybranych metod inteligencji obliczeniowej”. Postępowanie zostało przeprowadzone na Wydziale Inżynierii Mechanicznej i Informatyki Politechniki Częstochowskiej w dziedzinie nauk technicznych w dyscyplinie informatyka i zostało ono zakończone publiczną obroną rozprawy doktorskiej w roku 2014. Praca ta została obroniona z wyróżnieniem.